刚经过厌氧装置生产出来的沼气是一种含有水蒸气的混合气体，这些杂质气体会对以后沼气的使用产生一定的影响，所以需要对沼气进行净化。
沼气净化提纯是指去除沼气中CH4之外其它气体。现在沼气净化的方法有三种，即化学吸收，物理提纯和生物脱除。
1、化学吸收。
化学吸收是指选用胺等复合溶液吸收剂，使用酸碱中和原理吸收沼气中的CO2、H2S等酸性物质，一起也能吸收NH3等易溶于水、醇的气体。另一种化学吸收机理是选用干化学物质作为吸收剂吸收杂质气体。化学吸收的吸收剂都可以经过设备的自净体系和再生体系释放出各种杂质和气体得到再生循环运用。
2、物理提纯。
沼气净化提纯物理提纯的主要是变压吸附法，吸附剂在不同的压力条件下对不同气体的吸附力不同，通过这个原理来分离沼气中的不同组分。沼气中的H2O、CO2、H2S等吸附容量较大的强吸附组分在必定压力下被吸附剂吸附停留在床层中，而较小吸附容量的弱吸附组分N2、CH4 等从床层出口输出，然后实现了对沼气的净化。
3、生物脱除。
一些微生物在一定的条件下需要沼气中某些杂质作为营养物质来实现成长，然后实现对沼气的净化。
现阶段，沼气净化提纯物理化学法现已广泛地应用，但是此种方法耗资较大。生物法具有不需要催化剂和氧化剂、不需处理化学污泥、少污染、低能耗、高效率、可回收单质硫等优点，正在成为沼气脱硫领域的发展趋势。
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